Audrey Lavenu

Audrey Lavenu

Maîtresse de conférences en biostatistique (HDR)

Université de Rennes

Biographie

Audrey Lavenu est enseignante-chercheuse en statistique appliquée aux données médicales à l’Université de Rennes, enseignant principalement à la faculté de médecine, rattachée en recherche à l’Institut de Mathématiques de Rennes (IRMAR CNRS) et au Centre d’Investigation Clinique (CIC INSERM). Ses thématiques de recherche sont centrées sur les modèles de propagation d’épidémies, sur la modélisation des données de survie et d’événements récurrents, en y intégrant la problématique de la grande dimension nécessitant des méthodes d’apprentissage. Elle est aussi responsable du master 2 de Méthodes en Pharmacologie Clinique, biostatistique et Epidémiologie (MPCE) et impliquée dans la gouvernance de l’Université de Rennes sur les questions de handicap, de qualité de vie et conditions de travail, et d’action sociale.

Recherche

 
 
 
 
 
UMR CNRS 6625
IRMAR, Equipe Statistique.
UMR CNRS 6625
September 2019 – Present Rennes (35)

Soutenance d’Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) en avril 2023.

Projets actuels :

  • Evaluation de méthodes de machine learning en survie (collaboration Valérie Gares et Magalie Fromont de l’IRMAR + HeKA-Inria Université Paris Cité).
  • Co-direction de thèse de J. Murris « Prédictions d’évènements récurrents en grande dimension auprès de patients atteints de cancer digestif » (CIC1418 Inserm, HeKA-Inria, Université Paris Cité).
  • Diagnostics de non-identifiabilité de paramètres des modèles compartimentaux Susceptibles-Infectious-Removed (collaboration Samuel Jackson Durham et Dave Woods Southampton)
 
 
 
 
 
Faculté de médecine, Université de Rennes, CIC INSERM 1414
Maîtresse de conférences en biostatistique CNU 85.
Faculté de médecine, Université de Rennes, CIC INSERM 1414
September 2006 – Present Rennes
 
 
 
 
 
Statistical Sciences Research Institute, S3RI
Mobilité de 6 mois, chercheuse invitée à l’Université de Southampton.
Statistical Sciences Research Institute, S3RI
March 2019 – August 2019 Angleterre
 
 
 
 
 
Agrocampus, laboratoire de mathématiques appliquées
Maîtresse de conférences contractuelle.
Agrocampus, laboratoire de mathématiques appliquées
September 2005 – August 2006 Rennes
 
 
 
 
 
Université de Nantes, département de Mathématiques
Attachée Temporaire d’Enseignement et de Recherche, ATER.
Université de Nantes, département de Mathématiques
September 2004 – August 2005 Nantes
 
 
 
 
 
Université Pierre et Marie Curie, Paris VI
Doctorat de biomathématiques.
Université Pierre et Marie Curie, Paris VI
September 2000 – December 2004 Paris
Modélisation et analyse de la co-circulation de virus grippaux, diffusion en population, variabilité génomique et impact clinique.

Pédagogie

 
 
 
 
 
Université de Rennes
Responsable du master 2 Méthodes en Pharmacologie Clinique, biostatistique et Epidémiologie, MPCE.
September 2023 – Present
Investissement depuis la création du M2 en 2006, dont la fonction de correspondante double diplôme ENSAI MPCE
 
 
 
 
 
Enseignements
September 2006 – Present

plus de 200h équivalent travaux dirigés par an :

  • Modèles linéaires généralisés, M2 MPCE
  • Simulations en biostatistique sous R, M1 Santé Publique
  • Analyse de données biostatistiques sous SAS, M1 Santé Publique
  • Biomédecine quantitative, 3ème année de médecine
  • Corrélation et régression linéaire, 4ème année de pharmacie
  • Statistiques générales, M1 Nutrition et sciences des aliments
  • Modélisation compartimentale en épidémiologie, ENSAI 3ème année filière Sciences de la vie.
 
 
 
 
 
Université de Rennes
Encadrement de stages.
April 2007 – Present
de la licence au master 2, en passant par des étudiants en magistère et des projets de 2ème année ENSAI
 
 
 
 
 
Université de Rennes 1
Responsable du master 1 Santé Publique Parcours Sciences médicales.
September 2012 – August 2016

Activités administratives

 
 
 
 
 
Chargée de Mission pour la Qualité de Vie au Travail et action sociale.
April 2012 – Present

incluant :

  • Membre du bureau du Président de l’Université de Rennes,
  • Invitée permanente au CHSCT jusqu’en 2021,
  • Membre de la commission RH, de la Commission Consultative Paritaire des personnels, non-titulaires, et du comité d’action sociale du pôle QVT, dialogue social et action sociale de la DRH,
  • Vice Présidente entre 2020 et 2023.
 
 
 
 
 
Membre de la commission parité de l’IRMAR.
September 2020 – Present
 
 
 
 
 
Université de Rennes
Membre du comité d’organisation du séminaire mensuel MoVi de l’IRMAR.
Université de Rennes
April 2023 – Present
Modélisation Mathématique pour les Sciences du Vivant
 
 
 
 
 
INSA Rennes
Membre du comité d’organisation des Journées de la Statistique Rennaises.
September 2018 – April 2019
JSTAR 2019 sur le thème de la santé, organisées par l’INSA
 
 
 
 
 
Membre élue du Comité Pédagogique de l’UFR Médecine de l’Université.
September 2011 – September 2013
 
 
 
 
 
Université de Rennes 1
Membre élue du Conseil d’Administration UR1, et de la commission des finances.
Université de Rennes 1
April 2010 – April 2012
 
 
 
 
 
Chargée de Mission Promotion de la santé et vie sociale.
April 2008 – March 2012
Membre du Bureau du Président UR1, et membre de la commission Vie étudiante, dossiers centre de santé et berceaux en crèche entre autres.

Publications

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(2023). Gastroenteritis Forecasting Assessing the Use of Web and Electronic Health Record Data With a Linear and a Nonlinear Approach: Comparison Study. JMIR Public Health and Surveillance.

Cite

(2023). Towards filling the gaps around recurrent events in high dimensional framework: a systematic literature review and application. Biostatistics & Epidemiology.

Cite

(2022). Comparaisons de méthodes pour données de survie en grande dimension sur de petits échantillons : optimisation des hyperparamètres et validation.. 53ème Journées de Statistique de la SFdS, p879-885. 13-17 juin 2022, Lyon, France.

Cite

(2021). Influenza forecasting for French regions combining EHR, web and climatic data sources with a machine learning ensemble approach. Plos one.

Cite

(2020). New perspectives on difficult asthma; sex and age of asthma-onset based phenotypes. The Journal of Allergy and Clinical Immunology: In Practice.

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